Исправление Pinkbyte, (текущая версия) :
emerge -1uN app-emulation/virtualbox app-emulation/virtualbox-modules app-emulation/virtualbox-extpack-oracle--verbose-conflicts помогает к слову, если зависимостей не слишком дохрена
И да, частичные обновления боль, нужно понимать что от чего зависит. Если не понимаешь и не знаешь как посмотреть (emerge --tree, equery d, вот это вот всё) - глянцуй всё только через emerge -1uDN world (но и там могут быть конфликты, да)
Исходная версия Pinkbyte, :
emerge -1uN app-emulation/virtualbox app-emulation/virtualbox-modules app-emulation/virtualbox-extpack-oracle--verbose-conflicts помогает к слову, если зависимостей не слишком дохрена