В общем есть у меня /home reiserfs. Давно уже. Под терабайт. Пару раз переустанавливал систему (*ubuntu) и имел конфуз при установке связанный с отсутствием в списке этой fs. Соответственно приходится после установки руками прописывать все это дело в fstab.
Это конечно не фатально, но может есть какое слово магическое в опциях установки? Правда я их там последнее время вообще не наблюдаю.