LINUX.ORG.RU

19
Всего сообщений: 79

А есть какое-то свободное ПО для фрагментного анализа?

Сабж.

Пробовал NCBI OSIRIS под вайном - там все заточено сугубо под судебку, создать свою панель можно, но извернуться нужно существенно так. Для исследований не то, короче.

Peak Scanner 2.0 от Термофишера не читает файлы 3500 DX, помечая как якобы повреждённые, GeneMapper 5 их читает,но хочется что-то всё же свободное и под онтопик.

Fragman на 25% загрузки файлов вылетел, не хочет он файлы с ABI 3500 Dx читать… Хотя линь официально и не поддерживался - делали под макось и венду. Да и состыковать R с гуем - та ещё задача будет.

Fatools ещё не пробовал, но питон даёт надежду, что к этому хоть кути прикрутить можно будет, чтоб коллеги с консолью не долбались.

Может кто-то ещё варианты знает?

Молбиол ру тыкать бесполезно, кмк, форум там ща по большей части из спам-ботов состоит, а ведь хороший был форум.(

Если у кого есть идеи по сему специфическому вопросу - внимательнейше слушаю. Заранее спасибо!

 , , ,

Dorif ()

Вопрос про аккумуляторы

Нужны аккумуляторы, способные без особых проблем работать при низких температурах (до -30-40, чаще всего до -10), имеющие длительный срок хранения в заряженном состоянии и приобретаемые по цене, сильно меньше крыла Боинга. А то обидно было, когда батарея прибора при длительном измерении на холоду помахала лапкой и послала всех далеко и надолго.

Что можете посоветовать?

Спасибо!

 ,

Dorif ()

Свободный софт для фрагментного анализа

Собственно сабж. Надо анализировать всякие там QF PCR, MLPA, HID (SSR, STR, etc…). Есть ли свободные аналоги GeneMapper или GeneMarker? Сертификации для чего-то там не требуется, бо работа пока чисто научная.

Заранее спасибо!

 ,

Dorif ()

Пособия по Vulkan, OpenCL, MPI

Интересует сабж для С/С++. Если сие пособие для дебилов/зелёных в плане написания чего-то параллельного/гетерогенного мекбойзов - вообще хорошо будет. Языки - русский, английский, немецкий, румынский (ну а вдруг).

Заранее спасибо!

 

Dorif ()

Посоветуйте системный блок

Нужен смстемник для платы АТХ/ЕАТХ и двух блоков питания. Есть ли готовые решения или заколхозить на коленке, как истинный мекбойз?

Заранее спасибо!

 , ,

Dorif ()

Бред от синонимайзера

Здесь можно поделиться бредовым результатом жизнедеятельности данного синонимайзера: https://raskruty.ru/tools/synonymizer/

А вот и пример (моя новость первоначального вида, обработанная им):

Создатели дистрибутива Nitrux огласили об вырабатывании первоначальных удачно авралящих сборок, отрешенных от systemd. После практически 3 месяцев опытов завязалось проверка производств на базе SysVinit и OpenRC. Первоначальный вид (SysVinit) замечен как абсолютно авралящий, однако не чтимый как возвышенное заключение. Другой вид (OpenRC) покуда не удерживает GUI и включение к сети. В будущем намечается вдобавок отведать образовать монтирования с системами инициализации s6-init, runit и busybox-init.

Дистрибутив Nitrux сооружен на стопочной складе Ubuntu и вырабатывает свой пролетарий стол Nomad, развернутый на разработках KDE (рубка надо KDE Plasma). Для агрегата добавочных прибавлений используется система самодостаточных пакетов AppImage и центр агрегата прибавлений NX Software Center. Сам дистрибутив поставляется в фигуре 1-го файла и обновляется атомно с внедрением своего инвентаря znx. В критериях использования AppImage, неимения классического разбиения на пакеты и атомного обновления системы, применение systemd рассматривается как добавочное и очень осложненное заключение, так как для пуска базисных частей дистрибутива довольно простенькой системы инициализации.

Пожалуй, без комментариев…

 , , , ,

Marketersandmobile ()

Непонятки с ВТБ

Hydra Dominatus! Жил я себе спокойно, а сегодня мне пришло заказное письмо интересного содержания типа я должен банку ВТБ около 40 рублей (именно рублей, не килорублей!) по кредиту, взятому в 2013. Типа коллекторам передали (удачи им). При этом в РФ я был в 2008, 2010 и 2019 годах (в мае, на конференции по медгенетике, останавливался у товарища с ЛОРа, кстати. ЛОР - СИЛА! Спасибо ещё раз этому человеку!) и никаких дел с ВТБ не имел. И чё с этим делать и в каком порядке?

Жду советов и заранее спасибо!

 ,

Dorif ()

char * data представить как FILE * file возможно ли?

Ух, работа кипит, продолжая внедрять и внедрять кучу всяких мелочей в форк Corange захотелось остановится, стабилизировать его и сделать порт на первоначально android и может быть потом на Emscripten -> webassembly (уже предвкушаю как мой пукан будет бомбить от переноса OpenGL кода, ну да ладно). И если на нормальных хостах с загрузкой ресурсов всё ок, то на мобилке хотелось бы грузить ресурсы блобом и тут подумалось, а можно ли блок данных char * представить как FILE * stream ? да так что бы…


//получаем блок данных из блоба
char * data = blob_get_data(blob->data,"./facepalm.tga");
if(data != NULL)
{
    magic_char_to_file_register(data,"./facepalm.tga");
};

//где то далеко в кишках всё прозрачно загружается
//без каких либо изменений при реальном не существовании файла 
FILE * image_tga = fopen("./facepalm.tga","r");

То есть как то указать что данный блок данных это file stream, в таком случае не нужно будет до/переписывать код загрузки ресурсов. Мне кажется это довольно сильной шизофренией… но вдруг

 , , , ,

Deleted ()

Химия

Всем привет.
Жена столкнулась с неприятной вещью - незнанием химии. Просим помощи у специалистов за вознаграждение.

Для триацилглицерина заданного состава напишите уравнение реакций полного окислительного распада в анаэробных условиях с указанием названий соответствующих ферментов и их принадлежности к определенному классу.
Рассчитайте, какое количество АТФ может синтезироваться при полном окислительном распаде одного моля триацилглицерина.
Пересчитайте аккумулируемую энергию в килокалории на грамм.
Сравните полученный результат с данными средней калорийности жиров.
Объясните причины их расхождения.

Напишите соответствующие суммарные уравнения окисления заданного триацилглицерина и сопряженного окислительного фосфорилирования: Стеариновая, арахидоновая, олеиновая.

Для контактов: ник@protonmail.com

Для модераторов: с первым днем зимы) Вечером сам кину заявку на снос

 , , ,

admucher ()

А есть ли ещё софт, аналогичный UGENE?

Сабж. Наличие удобного гуя, особенно на Qt и наличие программы в разделе sci-biology Генты сторого приветсвуются.

P.S.: EMBOSS, конечно, тоже тот ещё комбайн, но кмк, менее расширяемый, чем UGENE.

Алсо: cast Axon DNA_Seq

 ,

Dorif ()

Дважды магистр теперь я!

Теперь и по молекулярной биологии. Опробировал и подготавливал к внедрению методику молекулярно-генетического скрининга на первичные иммунодефициты на реактивах, предоставляемых из Новосибирска.

Защиты после сурок сплю я как. Просыпаясь раз в 6 часов. Напряжение нервное снимается у меня так.

А Линукс тут при том, что анализ данных вёлся на нём.

 ,

Dorif ()

Распиновка кабеля для подогреваемого столика на Carl Zeiss Axiovert 25C

Ищу сабж. Микр есть, блока питания для подогреваемого столика нет. И если Т адаптер для фотопорта не проблема (просто кольцевой переходник с 34,5 мм на 1,25" Т адаптер от телескопа), то тут всё сложнее. Экспериментировать вслепую не хочется - мне с этим ещё работать.

Заранее спасибо!

 , ,

Dorif ()

Чем отделить монацит от магнетита и ильменита?

Сабж. Есть магнитная фракция песка, включающая в себя магнетит, ильменит и монацит, с небольшими примесями кварца, кальцита и циркона (захвачены чисто механически). Как же убрать эти примеси? Была идея промыть слабым раствором соляной кислоты или плавиковой, (может быть с фторидом калия или аммония). Но не разрушит ли это монацит?

Спасибо!

 , , ,

Dorif ()

Как мерять температуру грызунам?

Сабж. Для эксперимента надо температуру мониторить, пока или не выздоровеет, или не сдохнет. И да: при этом надо это делать так, чтоб грызун тя не укусил и не поцарапал.

Заранее спасибо!

# cast pyometra Axon DNA_Seq

 ,

Dorif ()

Как в UGENE собрать полный геном из контигов?

Собственно сабж. Пока что-то немного не получается.

И как можно с NCBI автоматически скачать последовательности? Качать все 299 контигов вручную задолбаюсь.

Заранее спасибо!

# cast DNA_Seq

 ,

Dorif ()

Софт под Linux для анализа данных с qPCR анализаторов.

Нужен сабж. Приходится периодически вручную выставлять параметры baseline и treshold, да ещё по-разному извращаться.

Анализатор Applied Biosystems 7500 выдаёт данные амплификации в формате .eds.

Задолбало, что для полноценного анализа надо сидеть за компом в комнате с анализатором, так как нигде больше этот софт не установлен, носитель для установки отсутвует и получается иногда, что нужно одновременно ставить новый эксперимент и анализировать старый.

Заранее спасибо!

# cast DNA_Seq Axon

 ,

Dorif ()

А шо я получил из цитрата натрия? *Вопрос для химиков*

Захотелось на Ж приключений - расчитал массы лимонной кислоты и соды, смешал, капнул воды. Ну опосля полученный цитрат натрия поставил в тигелек и на конфорку. А из него ПОПЕРЛО (так называемая фараонова змея получилась)

Два вопроса к местным химикам:

  1. Что за горючий газ полез? Пропан чтоли, или он распался до метана/этана?
  2. Полученный пепел я с чистой совестью раскрошил в воду и поставил отстаиваться. Как вы думаете, это я получил раствор NaOH? Или натрий весь куда-то делся?

Ах да, чего-то я забыл, cast Dorif

P.S. это в S&E наверно надо было, но я протупил...

Перемещено leave из talks

 , , ,

timdorohin ()

Ультрауберговнокод. Скажите, это еще лечится?

Собственно, сабж.

Единственный вопрос - можно вылечить такую кривизну рук? (Наставьте на путь истинный, меня ActionScript2 покусал в детстве)

P.S. Модераторам - если тут случится срачъ - перенесите в talks, пожалуйста...

 , , , ,

timdorohin ()

Инновации в области преобразователей энергии

http://gecs.ieee.tn/wp-content/uploads/2017/03/GECS2017PaperEDITED.pdf

Я один охреневаю от этого? Вкратце, якобы рабочий способ сильно уменьшить индуктивные компоненты импульсных преобразователей (на порядки!)

Вот только решив, что может я сам идиот и не понимаю всей гениальности сего изобретения, попытался покрутить его в симуляторе. Увидел ожидаемые килоамперы в контурах, любые транзы просто бомбанули бы нах в таких условиях.

Может я идиот и неосилил всю гениальность? Или что это вообще за хрень?

Просьба, кто кого знает, кастануть опытных инженеров в тред...

cast ncrmnt - может ты распарсишь идею автора статьи?

 , , ,

timdorohin ()

Как происходила смена денег при смене првителей?

Вот помер царь/император/кайзер/тиран/султан/фараон/кто-то-там-ещё, а новый начинает, естественно, штамповать свои деньги, чтоб непременно с его мордярой/гербом на аверсе. А старые деньги куда девались? Использовались наравне с новыми или заменялись по какому-то курсу (от 1:1 до 1:нифига)?

Заранее спасибо!

 , ,

Dorif ()