1. Чтобы он был доступен даже если /home сломался и проще было восстановить систему
2. Чтобы занимал дисковое пространство на разделе отличном от раздела пользхователей.
3. Чтобы в системах где домашние каталоги берутся из сети root оставался локальным и работал даже если сеть отваливается.