Вообще она ускоряет загрузку, но! 2 минуты она анализирует то, что запускается при старте, можно успеть запустить нужные программы после загрузки системы, она их учтет.
e4rat-collect defaults to replacing itself with /sbin/init upon completion. If you need to specify another PID 1, such as /bin/systemd, you can change this in /etc/e4rat.conf by setting the init parameter and uncommenting the line.
можно просто замедлиться самому. чем конкретно - не знаю. что-нибудь седативное - как минимум. короче, или всё начнёт летать (дорогу только аккуратнее переходите!), или будет фиолетово, за сколько запустилась прога - за 0.01 секунды или за 0.005.