Скорее всего такая возможность есть в aptitude, после получения списка доступных обновлений, там вроде появляется раздел, в котором пакеты, для которых есть обновления, там смотришь и устанавливаешь (обновляешь) только те, что необходимо, но более точно сказать не могу, давно Debian не использовал.
хм. Ну хотя и в yaourt это реализовано несколько костыльно, но удобно. Выглядит приблизительно так: шаг 1,шаг 2. Соответственно ненужные пакеты просто заккоменчиваются.
Ну, тоже вариант, да. В aptitude такого нет, но в принципе такое можно скриптом сделать (можно-то оно можно, но кто это будет делать?). Выгрузить обновляемые пакеты в файло, пользователь закомментирует ненужное, а потом опять скрипт запустить, который файло скушает, выцедит список незакомменченного и обновит эти пакеты.
yaourt это весьма фичастая обертка вокруг pacman. Так что не все у арчеров так плохо, как малюют ) И честно, я удивлен, что apt* не умеют подобного. особенно в свете того, что например иногда прилетают большие пакеты или апдейты ядра, которые тянут за собой пересборку initrd, что бывает не всегда уместным в данный момент.