zsh

export HISTSIZE=500000
export HISTFILE=~/.zsh_history
export SAVEHIST=500000

Вот кусок из ~/.zshrc:

...
# Определяем файл, в котором будет хранится история комманд
HISTFILE=~/.zhistory

# Максимальное количество комманд "запоминаемое" в текущем
# сеансе
HISTSIZE=1000

# Максимальное количество комманд, сохраняемых за один
# сеанс работы в HISTFILE
SAVEHIST=1000

# Добавлять комманды введенные во время сеанса работы в
# HISTFILE
setopt APPEND_HISTORY

# Не добавлять в историю комманд повторяющиеся комманды
setopt HIST_IGNORE_ALL_DUPS

# Игнорировать лишние пробелы в коммандах
setopt HIST_IGNORE_SPACE

# Удалять из файла истории пустые строки
setopt HIST_REDUCE_BLANKS
...

> # Добавлять комманды введенные во время сеанса работы в 
> #HISTFILE 
> setopt APPEND_HISTORY 
> 
> # Удалять из файла истории пустые строки 
> setopt HIST_REDUCE_BLANKS

у меня этих 2-х опций нет, но все равно добавляет, и пустых строк не сохраняет..