извлечь формулы из PDF

Зависит от ттго как туда эти формулы вставлены. В общем случае - перенабить. Или если качество не важно, то можно сделать скриншотов и вставить их в документ.

а если формулы созданы в latex или openoffice?

тогда лучше файноридером распознать

Единственный верный способ - отсканировать и распознать текст, а формулы набить руками. В латехе. Ибо офис sux.