Git Тупой вопрос

Локальный репозиторий — это поддиректория .git, создается (в пустом виде) командой git init и (в непустом виде с немедленным копированием содержимого родительского удаленного репозитория и простановкой ссылки на родителя) командой git clone.

(c)Wikipedia

От обычного скачивания у тебя не проставится remote origin например

Что ты подразумеваешь под «обычным скачиванием»?

Обычное скачивание, насколько я помню, это

git archive `git rev-parse --abbrev-ref HEAD` --prefix="`pwd | xargs basename`/" | gzip > `pwd | xargs basename`.tar.gz
wget `pwd | xargs basename`.tar.gz

А клонирование — это клонирование. Со всей историей и прочим. Очень часто история не нужна и будет полезным флаг --depth 1

Клонирование - это скачивание всего, в том числе и истории репозитория, и прочим. А скачивание это тупо скачивание только скриптов, или что это в репозитории :)