Сначала выполняю eix-sync чтобы обновить дерево portage. Потом, естественно, emerge -avuDN world с изучением списка изменений. Так же потом имеет смысл выполнить emerge -a --depclean, затем emerge @preserved-rebuild. Иногда - emerge -a @module-rebuild. Ещё есть какие-то (какие?) команды для обновления python, perl и так далее. Что вообще нужно выполнять после обновления мира для поддержания системы в актуальном состоянии?