Привет,
вот так выглядели шрифты в LyX версии 2.0.3 (если не изменяет память) под убунтой 11.xx: http://s22.postimg.org/ql77qjb0x/Screenshot_Ly_X_doc_Intro_lyx_read_only.png (1)
А так выглядят шрифты в LyX 2.0.3 (а также 2.0.6 и 2.1.0) под Ubuntu 13.04: http://s10.postimg.org/t47iudqzd/Screenshot_from_2013_08_03_18_20_38.png (2)
Возможно ли привести (2) к виду (1)? Если я правильно понимаю, разница в рендеринге шрифтов такова, что в первом случае используется RGBA, а во втором — grayscale сглаживание. В системных настройках выставлено RGBA сглаживание со slight хинтингом.