В каких программах делаются видео а‑ля презентации?

В любых, в которых умеешь делать кадры и накладывать эффекты, а потом всё собирать в видео. Это творческий процесс, который зависит от того, что лично ты умеешь. Есть даже такие извращенцы, которые поверпоинт умудряются для этого использовать. Вообще можешь поискать информацию по запросам «how to make video infographics» или «how to make animated infographics.

Вдогонку пример, как такое делают в Synfig Studio: https://www.youtube.com/watch?v=uVUUa3wk6JE

Препод на параллеле делает весьма неплохие, со встроенными самописными скриптами презентации на жаба скрипте + маркдовне, но, увы, что эта за библиотека я спросить не удосужился. Ну ещё видел как в маткаде иногда это делается, но это жутко неудобно.

flash mx 2004

но конкретно про это - читай https://www.3blue1brown.com/faq