В версии 3.6 было идеально: empathy запускался при старте системы, статус можно было видеть на панели, сообщения приходили с красивыми системными уведомлениями. Версию 3.8 я пропустил. Сейчас пользуюсь 3.10, ничего этого нет, только сообщения используют системные уведомления, если окно диалога не открыто. В 3.12, похоже, тоже ничего такого нет. Я понимаю, что они решили запилить GNOME Messages, но пока ничего не запилено. Могли бы и старые фичи не удалять.
Может быть, эти функции перенесли в какие-то экстеншоны? Кто чем пользуется?