Zabbix external check и python

запускать python хотябы в байткоде

Что? Питон всегда исполняет байткод. Даже в интерактивном режиме то что ты печатаешь сначала компилируется в байткод.

Хотелось бы чтобы компиляция была один раз, а не при каждом запуске т.е вроде как когда создается *.pyc и он не менялся, то запускается он.

Сделай pyc. py_compile.compile('script.py'), потом запускай python script.pyc

Я сделал, только Zabbix не понимает такой ключ:

/usr/bin/python script.pyc ["--param","{HOST.HOST}"]

Может

/usr/bin/python ["/path/to/script.pyc", "--param","{HOST.HOST}"]

zabbix то страдает сильно от этого?

заббикс не думаю что сильно страдает, а вот процессор очень даже :)