Образ системы из самой системы

чет типо rsync -av -e ssh user@host:/ /somepath/somefolder/ + mkisofs ?
не, нету

Можно просто все файлы в tar запаковать, главное не забыть ключи чтобы сохранять права и выкинуть лишние каталоги которые динамически заполняются.

И такие вещи как базы данных.

Acronis

шта это? ф топку его.

И такие вещи как базы данных.

Ну подобные сервисы придется остановить, это очевидно.

Можно исключить из копирования и сдампить естественным для него образом.

при использовании lvm - сделай снапшот и бекапь его.

Но с активно пишущими сервисами все равно нужно как-то договариваться.